accueil / serveurs / Recherche & Web / com.tomesphere/tomesphere
com.tomesphere/tomesphere
serveur MCP (Model Context Protocol) · tomesphere-mcp 0.1.0
Référencé dans l'annuaire. Seul le pentest comportemental fait foi, et il n'a pas encore été exécuté sur ce serveur.
Est-ce que com.tomesphere/tomesphere est sûr ?
Au dernier audit MCP Hub, le serveur MCP « com.tomesphere/tomesphere » est classé « Non encore testé ». Référencé dans l'annuaire. Seul le pentest comportemental fait foi, et il n'a pas encore été exécuté sur ce serveur. Le verdict est réévalué en continu ; consultez la fiche pour l'état à jour.
Méthode : MCP Hub analyse la description de chaque outil (couche 1) et, pour le verdict fort, exécute le serveur dans une micro-VM isolée avec leurres et réseau bloqué (couche 2). On publie des noms et des compteurs, jamais le contenu brut renvoyé par un outil.
Les 9 outils
- citations≈ 146 tokens
Get papers that cite the given paper (who refers to this work). Use when the user asks 'who cites X', 'what's the impact', or wants follow-up work. Note: 2024+ citation coverage is sparse; indexing in progress.
Paramètres, retour & exemple (2)
Paramètresk· integer · optionnel
Max citing papers (default 25, max 100).id· string · requis
arXiv ID or OpenAlex Work ID.
Exemple d'appel{"name": "citations", "arguments": {"id": "texte"}}Exemple de retour{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]} - get_entities≈ 122 tokens
Get the biomedical entities linked to a paper: genes, proteins, chemicals, diseases, species, mutations, cell lines, and clinical-trial (NCT) IDs. Accepts an arXiv ID, PMC ID, or bioRxiv/medRxiv DOI.
Paramètres, retour & exemple (1)
Paramètresid· string · requis
arXiv ID, PMC ID, or 10.1101/… DOI.
Exemple d'appel{"name": "get_entities", "arguments": {"id": "texte"}}Exemple de retour{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]} - get_figures≈ 114 tokens
Get a paper's real figure images — URLs, labels, and captions. Most biomedical papers have figures; arXiv papers often don't. Accepts an arXiv ID, PMC ID, or bioRxiv/medRxiv DOI.
Paramètres, retour & exemple (1)
Paramètresid· string · requis
arXiv ID, PMC ID, or 10.1101/… DOI.
Exemple d'appel{"name": "get_figures", "arguments": {"id": "texte"}}Exemple de retour{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]} - get_full_text≈ 129 tokens
Fetch a paper's full body text as Markdown (methods, results, protocols, inline tables) — use for deep questions the abstract can't answer. Accepts an arXiv ID (2401.12345), a PMC ID (PMC5339222), or a bioRxiv/medRxiv DOI (10.1101/…).
Paramètres, retour & exemple (1)
Paramètresid· string · requis
arXiv ID, PMC ID, or 10.1101/… DOI.
Exemple d'appel{"name": "get_full_text", "arguments": {"id": "texte"}}Exemple de retour{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]} - get_paper≈ 166 tokens
Fetch a paper's full metadata: title, authors, year, abstract, TLDR (LLM-generated), key findings, citation count, GitHub repos, HuggingFace models/datasets, videos, peer reviews, and links. Accepts an arXiv ID (e.g. '2401.12345' or '1706.03762v5') or an OpenAlex Work ID (e.g. 'W4390723197'). Use when the user names a specific paper or pastes an arXiv link.
Paramètres, retour & exemple (1)
Paramètresid· string · requis
arXiv ID like '2401.12345' or OpenAlex Work ID like 'W4390723197'.
Exemple d'appel{"name": "get_paper", "arguments": {"id": "texte"}}Exemple de retour{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]} - get_structure≈ 134 tokens
Resolve a gene/protein name (e.g. 'TP53', 'CD44') or UniProt accession to its 3D structure — returns the UniProt accession + AlphaFold model URL (and PDB when available). Great for a gene named in a paper's entities.
Paramètres, retour & exemple (1)
Paramètresname· string · requis
Gene/protein symbol (TP53, CD44) or UniProt accession (P04637).
Exemple d'appel{"name": "get_structure", "arguments": {"name": "texte"}}Exemple de retour{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]} - references≈ 124 tokens
Get the papers that this paper cites (its bibliography). Use when the user asks 'what does X cite' or 'show me the references'.
Paramètres, retour & exemple (2)
Paramètresk· integer · optionnel
Max references (default 25, max 100).id· string · requis
arXiv ID or OpenAlex Work ID.
Exemple d'appel{"name": "references", "arguments": {"id": "texte"}}Exemple de retour{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]} - search_papers≈ 240 tokens
Search 8.5 million academic papers (arXiv + biomedical: PMC / bioRxiv / medRxiv, all disciplines) by topic, keyword, author, or linked entity (gene / protein / disease). Each hit returns id, title, TLDR, type, and links. Use to find papers about a topic, e.g. 'transformer efficiency' or 'CRISPR base editing'.
Paramètres, retour & exemple (4)
Paramètresk· integer · optionnel
Number of results (default 10, max 25).query· string · requis
Natural-language search query. E.g. 'transformer attention efficiency', 'graph neural networks for molecular property prediction'.year_max· integer · optionnel
Latest publication year.year_min· integer · optionnel
Earliest publication year, e.g. 2024.
Exemple d'appel{"name": "search_papers", "arguments": {"query": "texte"}}Exemple de retour{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]} - similar_papers≈ 152 tokens
Find papers semantically similar to a given paper using SPECTER2 embeddings (trained on scientific-citation triplets). Returns nearest neighbors with TLDR. Use when the user wants 'papers like X' or 'what's adjacent to this work'.
Paramètres, retour & exemple (2)
Paramètresk· integer · optionnel
Number of neighbors (default 10, max 25).id· string · requis
arXiv ID or OpenAlex Work ID.
Exemple d'appel{"name": "similar_papers", "arguments": {"id": "texte"}}Exemple de retour{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
C'est votre serveur ?
Revendiquez-le sur l'espace créateur (preuve GitHub, domaine ou npm) pour afficher le badge « propriétaire vérifié » et lancer un pentest comportemental à la demande afin d'obtenir le badge « Vérifié ».