Combien d'outils expose io.github.nickjlamb/pubcrawl ?

io.github.nickjlamb/pubcrawl expose 14 outil(s). Le coût de contexte pour les charger tous est d'environ 2376 tokens (coût unique au chargement, pas par appel).

accueil / serveurs / Recherche & Web / io.github.nickjlamb/pubcrawl

io.github.nickjlamb/pubcrawl

serveur MCP (Model Context Protocol)

▸ Recherche & Web

[ Vérifié ]

Verdict MCP Hub
Aucun comportement malveillant détecté au test comportemental.

npmType / transport

directAccès

~2376 tokensCoût de contexte

14Outils

Est-ce que io.github.nickjlamb/pubcrawl est sûr ?

Au dernier audit MCP Hub, le serveur MCP « io.github.nickjlamb/pubcrawl » est classé « Vérifié ». Aucun comportement malveillant détecté au test comportemental. Le verdict est réévalué en continu ; consultez la fiche pour l'état à jour.

Méthode : MCP Hub analyse la description de chaque outil (couche 1) et, pour le verdict fort, exécute le serveur dans une micro-VM isolée avec leurres et réseau bloqué (couche 2). On publie des noms et des compteurs, jamais le contenu brut renvoyé par un outil.

Versions auditées & empreintes

Vérifiez la version que vous utilisez : son empreinte doit correspondre à celle listée ici — sinon vous n'utilisez pas la version auditée.

⚠ La dernière version publiée (2.7.1) n'a pas encore été auditée. Un nouveau pentest est programmé ; les verdicts ci-dessous portent sur les versions listées.

[ Vérifié ] v2.5.0 audité le 2026-10-21

sha512-xrnkrizdUPuuzfy6QqpbZfNT6fIf8cfyjabjuWze1PEyQH4k0FccVDOoMTZ8DNgJQBIzUstmUANXt+alX2bA9A==

npm view @pharmatools/pubcrawl@2.5.0 dist.integrity

Vous utilisez ce serveur ? Suivez-le (créez un compte) pour être alerté dès qu'une nouvelle version paraît ou que le verdict change.

Les 14 outils

search_pubmed≈ 209 tokens
Search PubMed for biomedical literature. Returns article summaries with PMIDs, titles, authors, journals, and DOIs.
Paramètres, retour & exemple (6)
Paramètres
- sort · string · optionnel · relevance | date
  Sort order
- query · string · requis
  PubMed search query
- dateTo · string · optionnel
  End date (YYYY/MM/DD)
- dateFrom · string · optionnel
  Start date (YYYY/MM/DD)
- maxResults · number · optionnel
  Maximum number of results
- articleType · string · optionnel
  Article type filter (e.g., review, clinical trial)
Exemple d'appel
```
{"name": "search_pubmed", "arguments": {"query": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
search_europepmc≈ 298 tokens
Search Europe PMC — a broader biomedical corpus than PubMed that also indexes preprints (bioRxiv, medRxiv), patents, and agricultural/biomedical databases. Unlike search_pubmed, each result includes an abstract snippet, citation count, open-access status, and whether a preprint. Use preprintsOnly to surface work ahead of formal publication.
Paramètres, retour & exemple (5)
Paramètres
- sort · string · optionnel · relevance | date | cited
  Sort order: relevance, date (newest first), or cited (most cited first)
- query · string · requis
  Search query (Europe PMC query syntax supported, e.g. field tags like AUTH, TITLE, JOURNAL)
- maxResults · number · optionnel
  Maximum number of results
- preprintsOnly · boolean · optionnel
  Restrict to preprints (bioRxiv, medRxiv, etc.)
- openAccessOnly · boolean · optionnel
  Restrict to open-access articles
Exemple d'appel
```
{"name": "search_europepmc", "arguments": {"query": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
get_abstract≈ 126 tokens
Get the full structured abstract and metadata for a PubMed article. Returns abstract sections (background, methods, results, conclusions), keywords, MeSH terms, and PMC ID.
Paramètres, retour & exemple (2)
Paramètres
- pmid · string · requis
  PubMed ID
- structured · boolean · optionnel
  Return structured abstract sections
Exemple d'appel
```
{"name": "get_abstract", "arguments": {"pmid": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
get_full_text≈ 144 tokens
Get the full text of an open-access article from PubMed Central. Returns article sections, figure/table captions, and reference count. Only works for articles available in PMC.
Paramètres, retour & exemple (3)
Paramètres
- pmid · string · optionnel
  PubMed ID
- pmcid · string · optionnel
  PubMed Central ID (e.g., PMC1234567)
- sections · array · optionnel
  Filter to specific section titles
Exemple d'appel
```
{"name": "get_full_text", "arguments": {"pmid": "texte", "pmcid": "texte", "sections": []}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
find_related≈ 128 tokens
Find related articles for a given PubMed article. Returns similar papers ranked by relevance score using PubMed's neighbor algorithm.
Paramètres, retour & exemple (2)
Paramètres
- pmid · string · requis
  PubMed ID to find related articles for
- maxResults · number · optionnel
  Maximum number of results
Exemple d'appel
```
{"name": "find_related", "arguments": {"pmid": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
format_citation≈ 111 tokens
Format a citation for a PubMed article in APA, Vancouver, Harvard, or BibTeX style.
Paramètres, retour & exemple (2)
Paramètres
- pmid · string · requis
  PubMed ID
- style · string · optionnel · apa | vancouver | harvard | bibtex
  Citation style
Exemple d'appel
```
{"name": "format_citation", "arguments": {"pmid": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
trending_papers≈ 175 tokens
Find recent/trending papers on a topic. Sorted by date, with optional filtering to high-impact journals.
Paramètres, retour & exemple (4)
Paramètres
- days · number · optionnel
  Number of days to look back
- topic · string · requis
  Topic or search term
- maxResults · number · optionnel
  Maximum number of results
- highImpactOnly · boolean · optionnel
  Filter to high-impact journals only
Exemple d'appel
```
{"name": "trending_papers", "arguments": {"topic": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
get_uspi≈ 155 tokens
Get FDA US Prescribing Information (USPI) for a drug from openFDA (cited to DailyMed). Returns structured labelling sections with LOINC codes.
Paramètres, retour & exemple (2)
Paramètres
- drug · string · requis
  Drug name to look up (e.g., 'metformin', 'atorvastatin')
- sections · array · optionnel
  Specific sections to retrieve (e.g., ['indications', 'adverse reactions', 'contraindications']). Returns all sections if omitted.
Exemple d'appel
```
{"name": "get_uspi", "arguments": {"drug": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
get_smpc≈ 150 tokens
Get UK/EU Summary of Product Characteristics (SmPC) for a drug from eMC (medicines.org.uk). Returns structured labelling sections.
Paramètres, retour & exemple (2)
Paramètres
- drug · string · requis
  Drug name to look up (e.g., 'metformin', 'atorvastatin')
- sections · array · optionnel
  Specific sections to retrieve — accepts numbers like '4.1' or names like 'indications'. Returns all sections if omitted.
Exemple d'appel
```
{"name": "get_smpc", "arguments": {"drug": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
compare_labels≈ 291 tokens
Compare US FDA Prescribing Information vs UK/EU SmPC for a drug side-by-side. Maps equivalent sections (e.g., US Indications ↔ UK 4.1) and returns paired verbatim content. A missing side is always explained: us_label/uk_label say whether the label was retrieved, each comparison notes why a section is null, and sections cut at the engine's length cap are flagged truncated.
Paramètres, retour & exemple (4)
Paramètres
- drug · string · requis
  Drug name to compare across US and UK labelling
- uk_drug · string · optionnel
  Name to use for the UK lookup when it differs from `drug` — brands often do (Farxiga/Forxiga, Prilosec/Losec). Defaults to `drug`.
- us_drug · string · optionnel
  Name to use for the US lookup when it differs from `drug` (e.g. a US-only brand). Defaults to `drug`.
- sections · array · optionnel
  Specific topics to compare (e.g., ['indications', 'adverse reactions']). Compares all mapped sections if omitted.
Exemple d'appel
```
{"name": "compare_labels", "arguments": {"drug": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
search_by_indication≈ 151 tokens
Find drugs approved for a medical condition. Searches US FDA labelling for the condition, then checks UK (eMC) availability for each drug found.
Paramètres, retour & exemple (2)
Paramètres
- condition · string · requis
  Medical condition or indication to search for (e.g., 'type 2 diabetes', 'hypertension')
- maxResults · number · optionnel
  Maximum number of drug results to return
Exemple d'appel
```
{"name": "search_by_indication", "arguments": {"condition": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
resolve_drug_name≈ 118 tokens
Convert a brand drug name to its generic name (or a generic to its US brand names), with drug class and common indications. Deterministic — sourced from RxNorm/openFDA, no AI.
Paramètres, retour & exemple (1)
Paramètres
- drug · string · requis
  Brand or generic drug name to resolve (e.g., 'Lipitor' or 'atorvastatin')
Exemple d'appel
```
{"name": "resolve_drug_name", "arguments": {"drug": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
search_trials≈ 316 tokens
Search ClinicalTrials.gov for clinical trials. Filter by condition, intervention, status, and phase. Returns trial summaries with NCT IDs, status, sponsors, and enrollment info.
Paramètres, retour & exemple (7)
Paramètres
- sort · string · optionnel · relevance | last_updated | start_date | enrollment
  Sort order for results
- term · string · optionnel
  General search term (searches all fields)
- phase · string · optionnel · EARLY_PHASE1 | PHASE1 | PHASE2 | PHASE3 | PHASE4 | NA
  Trial phase filter
- status · string · optionnel · RECRUITING | COMPLETED | ACTIVE_NOT_RECRUITING | NOT_YET_RECRUITING | TERMINATED | WITHDRAWN | SUSPENDED
  Trial recruitment status filter
- condition · string · optionnel
  Disease or condition (e.g., 'breast cancer', 'diabetes')
- maxResults · number · optionnel
  Maximum number of results (1-100)
- intervention · string · optionnel
  Drug or therapy (e.g., 'pembrolizumab', 'radiation')
Exemple d'appel
```
{"name": "search_trials", "arguments": {"sort": "relevance", "term": "texte", "phase": "EARLY_PHASE1", "status": "RECRUITING", "condition": "texte", "maxResults": 1}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```
get_trial≈ 118 tokens
Get detailed information about a specific clinical trial from ClinicalTrials.gov. Returns eligibility criteria, study design, arms, outcomes, locations, and associated PubMed IDs.
Paramètres, retour & exemple (1)
Paramètres
- nctId · string · requis
  ClinicalTrials.gov NCT identifier (e.g., NCT03086486)
Exemple d'appel
```
{"name": "get_trial", "arguments": {"nctId": "texte"}}
```
Exemple de retour
```
{"content": [{"type": "text", "text": "…"}]}
```

Badge pour votre README

Ce serveur a passé le pentest comportemental. Le badge porte son nom et renvoie à cette fiche — la preuve, c'est la fiche (verdict live qu'on contrôle), pas l'image.

Markdown

[![Vérifié par MCP Hub](https://dokore.fr/badge/io.github.nickjlamb--pubcrawl.svg)](https://dokore.fr/serveur/io.github.nickjlamb--pubcrawl)

HTML

<a href="https://dokore.fr/serveur/io.github.nickjlamb--pubcrawl"><img src="https://dokore.fr/badge/io.github.nickjlamb--pubcrawl.svg" alt="Vérifié par MCP Hub" height="20"></a>

Réévalué en continu : si le comportement change, le verdict tombe et le badge disparaît. Un badge qui ne pointe pas vers une fiche dokore.fr ne prouve rien. Comment ça marche

C'est votre serveur ?

Revendiquez-le sur l'espace créateur (preuve GitHub, domaine ou npm) pour afficher le badge « propriétaire vérifié » et lancer un pentest comportemental à la demande afin d'obtenir le badge « Vérifié ».

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Source

@pharmatools/pubcrawl@2.6.4